Pienimünsterinseisoja on täysiverinen metsästyskoira ja sen tulisi päästä toteuttamaan rodulleen tyypillistä toimintaa, eli metsästystä. Nämä koirat rakastavat juosta, etsiä hajuja ja noutaa. Yleensä ottaen sillä on paljon miellyttämisen halua, joka tulee esille sen monipuolisissa metsästysominaisuuksissa, koulutettavuudessa ja kykynä toimia erilaisissa maastoissa yhteistyössä omistajansa kanssa. Sen tehtäviä on toimia ennen ja jälkeen riistalaukauksen, eli ensin etsiä ja seisoa riistaa. Laukauksen jälkeen jäljittää ja noutaa ammuttu riista.
Pienimünsterinseisojan luonne on kuitenkin myös itsepäinen ja itsevarma. Siksi nuoren koiran koulutuksessa on tärkeää olla äärettömän määrätietoinen, mutta ei koskaan epäreilu tai kovakourainen. Pienimünsterinseisojalla on kova riistavietti, mutta se voi kypsyä hitaasti. Tämä on hyvä tiedostaa ja huomioida arjessa ja erityisesti metsästyskoulutuksessa ettei nuorelta koiralta vaadi liikaa. Pennun ja nuoren koiran kanssa tärkeintä on se, että tekeminen on mukavaa ja palkitsevaa. Pienimünsterinseisoja oppii todella nopeasti, jolloin koulutuksessa tulee edetä johdonmukaisesti ja tehtävien on oltava vaihtelevia ja tarpeeksi haastavia. Jos harjoitukset tapahtuvat aina samassa paikassa ja samalla tavalla, pienimünsterinseisoja kyllästyy nopeasti ja lakkaa tekemästä pyydettyjä asioita sekä alkaa keksimään mielekkäämpää tekemistä omistajan käskyistä huolimatta. Omistajan tulee varautua siihen, että ensimmäiset 1,5 - 2 vuotta voi mennä tottelevaisuuden ja riistalla hallinnan opetteluun. Kun tämän ajan jaksaa tehdä johdonmukaisesti töitä, aikuisena pienimünsterinseisojasta tulee mitä miellyttävin metsästyskaveri.
Tavallaan juuri jääräpäisyys ja älykkyys tekee niistä myös kestäviä ja monikäyttöisiä metsästyskoiria, koska ne ovat hyviä itsenäisessä ongelmanratkaisussa ja suhteuttavat omaa toimintaansa vallitseviin olosuhteisiin ja tilanteisiin. Opittuja taitoja tulisi myös muistaa pitää yllä, eli Ei tarkoittaa aina Ei ja Kyllä on Kyllä. Kun pienimünsterinseisoja huomaa omistajansa lipsuvan vaatimuksissaan niin se oppii nopeasti ennakoimaan ja tekemään omia ratkaisujaan.
Perusluonteeltaan pienimünsterinseisoja on ystävällinen, iloinen ja energinen. Se haluaa olla omistajansa lähellä ja osallistua kaikkeen tekemiseen, sekä miellyttää. Kaikki koiran kanssa yhdessä vietetty aika ja harrastaminen vahvistaa suhdetta ja yhteistyötä, joka kantaa hedelmää myös metsästykseen asti. Se on erinomainen perhekoira, mutta vastapainoksi vaatii paljon liikuntaa ja aivotyöskentelyä. Metsästyskauden ulkopuolella sen kanssa voi harrastaa muitakin lajeja, kuten näyttelyitä, jäljestystä, vetourheilua, tottelevaisuutta, agilityä ja nenänkäyttöä. Koulutettavuuden, työskentelyhalukkuuden ja ystävällisen luonteen johdosta se soveltuukin koko perheen harrastuskoiraksi ympäri vuoden.